Pour ceci, on utilise l'outil ffplay

ffplay -vf "drawtext=text='%{pts\:hms}':box=1:x=(w-tw)/2:y=h-(2*lh)" J1.mp4

où J1 est le fichier à jouer. Les millièmes de secondes s'affichent

Pour "ecrire" le temps dans le fichier et qu'il soit toujours dans le video : 

ffmpeg -start_at_zero -copyts -ss 00:00:14.435 -i showfreqs.mp4 -vf "drawtext=fontfile=/path/to/Arial.ttf: fontsize=45:fontcolor=yellow:box=1:boxcolor=black:x=(W-tw)/2:y=H-th-10:text='Time\: %{pts\:hms}'" outputTemps.mp4